داستان فیلم «مصلحت» از آنجایی آغاز میشود که «مهدی» پسر آیتالله مشکاتیان که یکی از مقامات بلندپایه قوهی قضائیه است، مرتکب قتل میشود، اما از پذیرفتن آن سر باز میزند و اطرافیان پدرش به خاطر مصلحت نظام و انقلاب، سعی میکنند کسی دیگر را به جای او متهم جلوه دهند. فضای فیلم در سالهای اول بعد از انقلاب و برگرفته از یک ماجرای واقعی است.